Il sistema effettua automaticamente l'annullamento dei CIC, entro i limiti di legge e disponibilità, ai fini dell'assolvimento dell'obbligo, imputando dapprima i certificati emessi nell'anno precedente (nell'ordine CIC5, CIC8, CIC10) e a seguire quelli rilasciati nell'anno in corso (CIC).
In caso di presenza di un debito pregresso, poiché occorre sempre estinguere prima quest'ultimo, il sistema imputa i CIC per sanare tale debito e, successivamente, i CIC da utilizzare per ottemperare all'obbligo oggetto di verifica nell'anno in corso.